Après le kidnapping d'un architecte spécialisé dans les bâtiments sécurisés, l'équipe tente de le ramener à la maison. Deeks et Kensi réalisent qu'ils vont devoir trouver de l'aide pour les devoirs de Rosa...

L'équipe du NCIS joint ses forces à celles du FBI, lorsqu'un groupe de meurtriers macabres, connu sous le nom des Couseurs de Corps, revient après avoir échappé au NCIS des années auparavant. Le père de Sam se fait un nouvel ami, en la personne d'Arkady...

L'équipe du NCIS est à la recherche d'un suspect et d'un mobile à la suite du bombardement d'un bâtiment où on assemble des drones de combat. Callen et Killbride reçoivent de troublantes nouvelles à propos d'un corps découvert en Syrie...

L'avion d'Aiden Hanna subit un terrible accident et se crashe et il en est tenu pour responsable. L'équipe de NCIS doit alors enquêter pour laver son nom.

Le NCIS est appelé pour enquêter, lorsqu'une femme est aperçue fuyant la scène de crime du meurtre de son mari. Roberta Deeks se rend en ville pour rencontrer Rosa, et Sam cherche un auxiliaire de vie pour s'occuper de son père...

Le NCIS est appelé à enquêter après que le contre-amiral Ted Gordon a été enlevé chez lui. Ils se lancent dans une chasse au trésor. Kensi s'efforce d'être un parent amusant, tandis que Deeks se lance à la recherche d'un appartement, en compagnie de sa mère...

Un marine tombe malade pendant une mission d'entraînement, à cause d'une arme génétique et le NCIS doit traquer la personne responsable. Marty Deeks peine à concilier travail et vie privée lorsque Rosa attrape la grippe...

Le NCIS enquête sur un incendie à Global West Ventures Corp, un entrepreneur en défense navale. Devin Rountree reprend contacte avec une ex, tandis qu'Hollace Killbride donne des dossiers sur Pembrook à Callen...

Quand l'équipe de la NCIS enquête sur une fusillade sur un bateau, dans lequel un objet culturel rare est volé, ils sont choqués d'apprendre qui possède le dit bateau...

L'enquête conjointe des équipes du NCIS Washington, Hawaï et Los Angeles atteint un point culminant lorsque les agents Namazi et Rountree découvrent une menace encore plus grande : la tête de chaque membre du NCIS a été mise à prix pour 200 000 dollars sur le dark web. Des membres de cartels, des tueurs à gages et autres psychopathes sont très intéressés par cette forte récompense.

Lorsqu'un ancien Navy Seal, Tom Olsen, l'ami de Sam, se retrouve traqué par des ennemis de son passé, l'équipe du NCIS doit découvrir qui est à ses trousses.

A Washington DC, on célèbre le départ à la retraite d'un ancien professeur. Mais le NCIS doit en même temps enquêter sur son suicide et ils apprennent que chaque membre est visé par des tueurs à gages, chacun ayant une prime de 200 000 dollars pour leur tête...

Une femme mystèrieuse attaque le fondateur d'une compagnie d'IA et l'équipe doit déterminer son identité, avant qu'un conflit majeur ne s'en suive.

Lorsqu'un quartier-maître est retrouvé mort en ayant rédigé ce qui semble être une lettre de suicide, l'équipe du NCIS doit enquêter sur le mystère autour de son décès. Callen et Anna commencent à planifier leur mariage et Sam a une discussion à coeur ouvert avec sa fille...

Sam Hanna doit se faire passer pour un combattant afin d'arrêter le chef d'un gang qui trafique de la drogue. La mission comporte des risques évidents.

Lorsque l'équipe du NCIS reçoit un message crypté et urgent, Fatima et Rountree doivent travailler ensemble pour résoudre l'affaire. Par ailleurs, Kilbride prévoit de rendre visite à son fils, et Callen demande à Sam d'être son témoin...

L'équipe du NCIS est chargée d'aider l'unité des affaires non résolues du NCIS sur une affaire datant de 2003 et sur la disparition d'un quartier-maître de la marine. Par ailleurs, Kilbride et son fils, Alex, tentent de reconstruire leur relation...

L'équipe du NCIS doit enquêter lorsqu'un réserviste de la marine est poignardé et que son laboratoire rempli de pesticides et d'insectes est saccagé. Par ailleurs, Kilbride offre à Sam le poste de directeur des opérations par intérim et Rountree réfléchit à son avenir...

Lorsque quatre personnes, dont un agent de la CIA, sont abattues en plein jour, l'équipe du NCIS soupçonne que ces attaques sont liées à DRONA. De plus, Pembrook rencontre Callen et lui donne plus d'informations sur son passé...

Lorsqu'un agent de l'ATF est porté disparu, le bureau demande l'aide de l'équipe du NCIS pour enquêter sur le vol d'armes militaires et localiser l'agent. Callen et Anna continuent de planifier leur mariage, les entretiens de la soeur de Rountree à l'école de médecine aussi et Sam encourage son père à participer à un essai clinique...

L'équipe du NCIS poursuit sans relâche son enquête avec l'ATF pour retrouver les armes militaires volées. Callen et Anna décident d'un mariage impromptu.