A New York, Leonardo, Raphaël, Donatello et Michelangelo, quatre frères tortues mutantes, entament leur adolescence. En sortant des égouts, où ils ont élu domicile, ils découvrent des armes magiques qui leur confèrent des pouvoirs de ninjas. Aussitôt, la fratrie se lance dans des aventures époustouflantes. Les Tortues Ninja sont de retour en version animée dans cette série pleine de rebondissements et fidèle à l'univers d'origine.