Le corps d'un homme flotte sur la Méditerranée. Repêché par des marins, le naufragé est incapable de se souvenir de son nom. Ramené à Marseille, il découvre un microfilm placé sous sa peau et apprend qu'il s'appelle Jason Bourne. Il entreprend alors un voyage à travers l'Europe pour retrouver son passé...