Rien ne va plus chez Tony Soprano. Capo d'une famille mafieuse du New Jersey, il ne s'entend plus avec sa femme, Carmela. Ne parvenant plus à faire face aux multiples pressions qui s'exercent sur lui, il décide de consulter une psychiatre, la séduisante Jennifer Melfi, pour maîtriser ses angoisses...

Tony s'inquiète pour le Parrain, hospitalisé pour un cancer inopérable. Pour lui remonter le moral, Tony engage une stripteaseuse déguisée en infirmière. Quant à Meadow et son amie Hunter, elles supplient Christopher de leur fournir de la drogue afin de les aider à préparer leurs examens...

Christopher et son complice ont restitué le camion volé à la société Comley. Mais oncle Junior ne semble pas vouloir en rester là avec eux. Pendant ce temps, Tony est accablé par les soucis : il doit faire face à la maladie d'un ami et à ses remords après l'explosion du restaurant d'Artie Bucco...

Christopher et sa petite amie Adriana découvrent le corps inanimé de Brendan dans sa baignoire. Christopher estime que cette mort est liée à une vente de drogue à Meadow, la fille de Tony. Quant à ce dernier, il a failli être surpris par Silvio alors qu'il entrait dans le cabinet du docteur Melfi...

C'est bientôt la rentrée scolaire. Tony et Meadow partent pour le Maine afin de trouver un établissement scolaire convenable pour la jeune fille. Ce voyage est l'occasion pour le père et la fille de se retrouver et d'évoquer leurs problèmes respectifs. Meadow en profite pour questionner Tony sur la Mafia...

Oncle Junior est devenu le patron et n'entend pas respecter les engagements pris par son prédécesseur, Jackie Aprile. Tony s'efforce d'éviter une confrontation directe en demandant à sa mère de le raisonner. Mais la vieille femme, dépitée d'avoir été placée en maison de retraite, refuse d'intervenir...

Après avoir volé du vin de messe, Anthony Junior est arrivé ivre en classe. Il est exclu pour quelques jours, et ses parents sont convoqués pour un entretien avec le psychologue. Tony se souvient alors de son enfance. Anthony commet une gaffe en révélant à Livia que Tony voit une psychothérapeute...

La rumeur se répand comme une traînée de poudre : des inculpations sont sur le point d'être prononcées. La moitié des membres de la mafia new-yorkaise a déjà quitté la ville. Tony et ses associés décident de rester, mais de faire un peu de ménage au cas où la police leur rendrait visite...

Alors que le FBI resserre son étau sur les Soprano, oncle Junior veut empêcher Bobbi, sa maîtresse, de faire état des soins qu'il déploie pour la combler. Mais Carmela a vent des confidences de la belle et en informe Tony. Celui-ci se fait une joie d'y faire allusion lors d'une partie de golf...

Tony et son équipe récupèrent un gros paquet d'argent en délestant et tuant un dealer colombien qui s'était mis en tête d'opérer sur le territoire des Soprano. Alors qu'ils fêtent leur bonne fortune au champagne et en galante compagnie, Christopher emmène sa petite amie Adriana au théâtre à New York...

Vin Makazian a une information de taille pour Tony : il semblerait qu'un de ses anciens amis, Pussy Bonpensiero, aurait fait certaines révélations sur la famille Soprano à la police et au FBI. Tony a beaucoup de mal à croire à ce revirement, mais prend néanmoins la décision d'éliminer le traître...

Pussy Bonpensiero n'est toujours pas réapparu et Tony déprime. Son clan s'inquiète car il néglige les affaires. Le docteur Melfi augmente sa dose d'antidépresseurs et y ajoute du lithium pour le faire sortir de son marasme. Mais rien ne semble marcher jusqu'à ce que Tony rencontre Isabella...

Jimmy, soupçonné d'être l'informateur de la police, est mis hors d'état de nuire. Mais Tony a d'autres chats à fouetter. En effet, lors d'une séance chez son thérapeute préféré, le docteur Melfi, il prend conscience que sa mère pourrait bien être impliquée dans l'attentat dont il a été victime...