Esteban, Zia et Tao reprennent leur quête des cités d'or à bord du Grand Condor, un oiseau mécanique qui leur permet de voler en utilisant l'énergie solaire. Leurs pérégrinations les entraînent notamment en Chine et au Tibet. Au cours de leur expédition, les enfants rencontrent Ambrosius, un alchimiste français, et se retrouvent poursuivis par le mystérieux Zarès.