Alors que Pie XIII est toujours dans le coma, un premier conclave tumultueux est organisé afin d'élire un nouveau pape. Sir John Brannox, un aristocrate britannique modéré et sophistiqué, est propulsé nouveau souverain pontife presque malgré lui, grâce aux manœuvres du secrétaire d'Etat du Vatican, Angelo Voeillo. Sous le règne de Jean-Paul III, l'Eglise va se retrouver notamment aux prises avec une grève des nonnes dans la chapelle Sixtine.