Les historiens situent le premier massacre de juifs en 38, à Alexandrie, qui abritait une communauté juive florissante. Dès le IIe siècle, l'ardeur du prosélytisme ruine l'entente entre chrétiens et juifs, les premiers accusant les seconds de déicide. Aux XIe et XIIe siècles se déroulent les premières croisades, qui combattent les musulmans mais aussi les juifs, vus comme l'ennemi intérieur.