Une équipe d'agents du FBI voyage dans le monde entier pour protéger les citoyens américains en danger et neutraliser les menaces contre les intérêts du pays.
La Fly Team et le nouvel officier de liaison Megan "Smitty" Garretson enquêtent sur le meurtre d'un inspecteur fédéral à Paris qui soupçonnait une société américaine de vendre illégalement des armes en France et au Moyen-Orient.
Lorsqu'un prédateur local se met à exploiter des Américaines mineures, la Fly Team tente de faire passer le délinquant devant la justice avec l'aide d'une des victimes. Kellett décide de trouver un colocataire.
Lorsqu'une ancienne Marine est détenue à Istanbul pour trafic illégal d'antiquités, la Fly Team doit se dépêcher d'organiser sa libération avant que la police turque ne découvre la vérité sur sa visite.
La Fly Team fouille Bucarest pour retrouver une mère porteuse roumaine disparue peu après avoir porté l'enfant d'un couple d'Américains. Forrester s'inquiète de plus en plus pour la sécurité de ses voisins à Budapest.
Quand le garde du corps et la petite amie d'un homme d'affaires américain sont kidnappés devant lui à Barcelone, la Fly Team doute de son innocence. Raines se rapproche de Maya, la patronne d'un bar où l'équipe a ses habitudes.
Vo part en couverture quand la Fly Team enquête sur le décès mystérieux d'un mannequin américain à Milan. Kellett est prise de court quand Dandridge demande à avoir de la visibilité sur l'affaire.
Lorsqu'un basketteur américain jouant pour une équipe lituanienne fait un arrêt cardiaque, la Fly Team enquête aux côtés de Zoey McKenna (Kelley Missal), le nouvel agent nommé par Dandrige.
La Fly Team et Smitty retrouvent Jaeger à Berlin pour enquêter sur le meurtre d'un Allemand par un Américain non identifié, la victime se révélant être un ancien agent infiltré de la Stasi en Allemagne de l'Est au cours de la Guerre froide.
La Fly Team enquête sur la mort d'un avocat américain tué par l'explosion de sa voiture à Budapest. Kellett se rapproche du lieutenant hongrois Benedek Erdős (Miklós Bányai) tandis que l'affaire délicate progresse.
La Fly Team et Smitty se rendent au Maroc après que l'avion d'un vol commercial New York - Athènes a été empêché de décoller et qu'un citoyen américain soit porté disparu. La relation entre Kellett et Erdős (Miklós Bányai) continue de s'épanouir.
La Fly Team prête main forte à la police hongroise lorsque l'un de leurs officiers est accusé du meurtre d'un couple à Budapest. Kellett remet en question sa relation avec le lieutenant Erdős.
Lorsque l'enlèvement d'un architecte américain à Rome se retrouve lié à une menace terroriste à New York, les agents du FBI Jubal et Nina se joignent à Forrester et à sa Fly Team en Italie.
La Fly Team se rend à Vienne pour trouver l'auteur d'une attaque à l'acide sur une danseuse étoile américaine prometteuse. Smitty reçoit des renseignements perturbants de la part de quelqu'un qu'il connaît.
Suite au meurtre d'un touriste américain en visite à Stockholm avec sa petite amie, la Fly Team doit unir ses forces pour neutraliser un groupe suédois responsable du crime.
Après le cambriolage de l'une des plus grosses banques suisses par un expert en cybersécurité, la Fly Team est appelée pour localiser le fugitif. La loyauté de Smitty est mise à l'épreuve.
Lorsqu'un missile russe est volé et mis sur le marché noir à Budapest, la Fly Team doit le mettre à l'abri avant qu'un mystérieux vendeur d'armes américain ne le remette entre de mauvaises mains.
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