Avec l'aide de leur nouvelle analyste, l'agent spécial Amanda Tate, la Fly Team s'efforce de remettre de l'ordre après qu'une explosion massive a ébranlé le quartier général et que leur principal suspect s'est volatilisé.

Lorsque l'ex-agent du FBI Bill Cormack, capturé il y a des années Libye, refait surface dans une prison de Tripoli, Forrester et Powell risquent tout pour le faire évader. Le reste de la Fly Team tente de s'adapter à son nouveau QG.

Lorsque la fête d'anniversaire d'une jeune fille américaine est interrompue après que sa mère a été retrouvée morte, la Fly Team se rend à Monaco pour retrouver le meurtrier. Pendant ce temps, Vo commence à voir Raines sous un nouveau jour.

La Fly Team se rend en Bulgarie à la recherche d'un criminel qui exploite des jeunes filles américaines mineures. Pendant ce temps, Raines s'interroge lorsque Forrester lui demande de garder un œil sur Powell.

Lorsqu'un ancien membre du gouvernement américain est arrêté à Vienne, la Fly Team s'y rend pour enquêter.

La Fly Team est appelée à enquêter lorsqu'une étudiante américaine est arrêtée dans une auberge de Prague pour avoir fait preuve d'agressivité à l'égard de la police locale qui n'a pas tenu compte de ses accusations d'abus sexuel.

La Fly Team se rend dans la campagne toscane après l'enlèvement du fils d'un couple d'Américains devant leur nouvelle maison. Les inquiétudes s'intensifient lorsqu'ils comprennent que la mafia pourrait être impliquée dans l'affaire.

L'agent spécial du FBI, Jubal Valentine, se rend à Budapest pour aider personnellement la Fly Team et la CIA à démanteler le cartel qui a assassiné son ancienne petite amie et collègue.

Quand un mercenaire américain prétendant lutter contre le trafic d'enfants est arrêté par la police roumaine après que son équipe a été soupçonnée de détournement de fonds, Tate et Raines tentent de l'amener à dénoncer le chef du groupe.

Lorsqu'une nuit de folie à Amsterdam pour trois ex-Marines se termine par la mort de l'un d'entre eux dans sa chambre d'hôtel, la Fly Team doit explorer le quartier chaud pour traquer son meurtrier.

Un ancien membre de l'Armée républicaine irlandaise devenu citoyen américain est abattu à Londres.

Lorsque le propriétaire d'une société de cybersécurité est assassiné à Copenhague, beaucoup de données sont divulguées, ce qui pousse la NSA à demander l'aide de la Fly Team, ainsi que celle de l'agent de liaison du Bureau auprès de la NSA.

Après avoir été informée que deux ressortissants norvégiens sont retenus prisonniers en Russie, la Fly Team se rend à Oslo.