Dans un monde fantastique aux univers multiples, une jeune orpheline parcourt les Royaumes du Nord à la recherche de son ami disparu.

Lyra s'installe dans le luxueux appartememnt de madame Coulter, à Londres. Emerveillée par tout ce qu'elle découvre, elle ne peut cependant s'empêcher de s'inquiéter de l'avancée des recherches pour retrouver Roger. Les gitans cherchent à savoir où sont retenus tous les enfants qui ont disparu...

Lyra et Pan sont sauvé des Enfourneurs par Tony et Benjamin. Ma Costa héberge la jeune fille, qui accepte à contrecoeur de rester avec les gitans le temps de retrouver Roger. A la recherche de Lyra, madame Coulter met Jordan College à sac et découvre que la fillette possède un précieux objet...

L'aéronaute Lee Scoresby arrive à Trollesund, à la recherche de Iorek Byrnison. Tenu pour responsable d'un carnage, cet ours a été privé de son armure par le Magisterium et travaille comme simple ouvrier. Lyra et les gitans sont également sur place. Farder Coram souhaite contacter la sorcière Serafina...

Lyra et les gitans poursuivent leur route vers le Nord. L'aléthiomètre indique que la jeune fille doit se rendre dans un village de pêcheurs, mais ses compagnons hésitent à la laisser s'aventurer seule. Iorek accepte de veiller sur elle. Dans une réalité alternative, Thomas et Boreal surveillent les Parry...

A Bolvangar, où sont retenus les enfants enlevés par les Enfourneurs, Lyra se fait appeler Lizzie. Elle est soulagée de retrouver Roger sain et sauf et découvre que des expériences y sont menées pour tenter de séparer les jeunes prisonniers de leurs daemons. La visite de madame Coulter l'oblige à se cacher...

Lyra est capturée et présentée à Iofur Raknison à Svalbard. Elle parvient à lui faire croire qu'elle est le daemon humain d'Iorek, créée par des scientifiques à Bolvangar. Un terrible combat a lieu. Boreal rend visite à Elaine Parry et insiste pour qu'elle lui remette les lettre rédigées par son mari...

Alors que le magisterium est toujours à ses trousses et se rapproche inexorablement, Lyra en apprend davantage sur la rébellion menée par Asriel. Elle persiste à lui apporter à son aide, ce qui va lui coûter cher.