En 1557, la France est à l'aube des guerres de Religion et les protestants sont traqués. Jean de Siorac, un humaniste acquis aux idées de la Réforme, et Jean de Sauveterre, son frère d'armes, se sont retirés derrière les remparts de leur château dans le Périgord noir. Une double menace pèse sur les deux amis...

Alors que Siorac repart au combat sans s'être réconcilié avec Isabelle, le château de Mespech est menacé par Fontenac, allié à des brigands venus d'au-delà des Pyrénées. Isabelle et Sauveterre unissent leurs forces et organisent la défense du domaine, tandis que Pierre se rapproche de son demi-frère Samson, creusant le fossé avec François...

Après une résistance héroïque menée par Isabelle, le château est sauvé des brigands, révélant la trahison de Fontenac. Revenu de la guerre couvert de gloire, Siorac, devenu baron de Mespech, en profite pour annoncer la conversion de la communauté au protestantisme, malgré l'opposition d'Isabelle...

Après leur conversion, Siorac et Sauveterre aspirent à la paix, en dépit de la résistance d'Isabelle et des autres femmes de la maison. A l'extérieur du château, le pays se déchire. Prise en otage par un chef protestant fanatique, Isabelle est sauvée in extremis par Siorac. Les époux se réconcilient, Isabelle tombe à nouveau enceinte...

La mort d'Isabelle laisse Jean inconsolable et Pierre porteur d'un lourd secret. La peste ravage la région. Fontenac, l'ennemi juré, supplie Siorac de sauver sa fille Diane atteinte de la maladie. Jean accepte à condition qu'elle soit mise en quarantaine, et réussit à la guérir. François s'éprend de Diane, tandis que Pierre découvre l'amour avec Hélix...

Le courage des Siorac père et fils a sauvé Sarlat de la famine. Lors d'une cérémonie en leur honneur devant toute la ville, un duel de démonstration entre Pierre et François se transforme en bagarre sans merci. François révèle la médaille catholique de Pierre, provoquant la colère de Siorac. Désobéissant à son père, François demande la main de Diane à Fontenac, qui tend un piège à Siorac...